热带雨林的砍伐对生物多样性和整个生态系统产生了广泛而深远的影响。美国加州大学的科学家们正在研究亚马逊热带雨林的微生物多样性对土地利用的响应，以及这些变化对温室气体甲烷循环的影响。

该项研究的结果将被用于评估亚马逊热带雨林生物多样性受森林砍伐影响大小和寻求恢复的方法，也可用于了解微生物在转变的生态系统中调节甲烷气的能力。

该研究项目是2014年美国国家科学基金会（NSF）生物多样性维度计划（Dimensions of Biodiversity Program）资助的12个新项目之一。NSF的生物局和地理局、圣保罗研究基金会和中国国家自然科学基金会将向生物多样性维度计划共同注资2300万美元。

生物多样性维度计划的研究方法独特，与传统的生物多样性研究着重于生态系统分类不同，该计划将多个方面的因素都整合到了研究项目中。该计划将结合生物多样性的功能、基因组和系统发育等多个研究方向，快速加深人们对生殖、生物多样性维护和损失的了解。其研究结果将弥补现有生物多样性知识的空白与缺失，未来还将对农业、燃料生产、制造业和人类健康产生重大影响。

这个生物多样性新计划的研究重点包括：微生物与潮间带藻类的相互作用，以及为了应对自然和人为因素它们之间关系发生的变化；微生物新种在西部松树林中修复大气氮的作用；了解微生物群在永久冻土区的多样性和适应策略；研究使酵母菌群多样化的遗传和生态因素；以及水生环境中的植物新陈代谢策略的多样化问题。

生物多样性维度计划还资助以下研究：休眠在维持微生物的生物多样性中的作用；蚂蚁和它们的肠道菌群之间的关系和相互作用；蝙蝠的感官适应机制；在美国和中国森林中的植物和微生物的平行关系，以及历史限制和局部适应性对这些相互作用的影响；食物链中的南美植物、毛毛虫和寄生虫相互关系的多样性；如何用珊瑚微生物群落的多样性来解释珊瑚受压力和疾病影响的整体脆弱性等。