据美国谷歌旗下DeepMind公司官网2020年11月30日报道,该公司所开发的最新版本人工智能系统AlphaFold在国际蛋白质结构预测竞赛(CASP)上击败了其余的参会选手,破解了困扰生物学家50年的难题——蛋白质折叠问题,精确地基于蛋白质的氨基酸序列预测了蛋白质3D结构,准确性可与冷冻电子显微镜、核磁共振或 X 射线晶体学等实验技术相媲美,对药物设计和环境可持续性等领域有着深远的影响。
在最新版AlphaFold中,DeepMind 团队创建了一个基于注意力的神经网络系统,通过端到端的训练来解释蛋白质3D结构,同时对构建的隐式结构进行推理,并使用多重序列对齐 (MSA) 和氨基酸残基对表示来完善结构。通过迭代这个过程,系统可以对蛋白质的基本物理结构进行准确的预测,并能够在几天的时间内确定高度精确的结构。
王立娜 供稿自